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计量学报  2023, Vol. 44 Issue (5): 826-832    DOI: 10.3969/j.issn.1000-1158.2023.05.23
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新型冠状病毒B.1.1.7变异株特异性数字PCR定量方法研究
王霞1,郭若晖1,2,董莲华1
1.中国计量科学研究院,北京 100029
2.上海海洋大学,上海 201306
The Establishment of Digital PCR Quantitative Method for Strain B.1.1.7 of SARS-CoV-2
WANG Xia1,GUO Ruo-hui1,2,DONG Lian-hua1
1. National Institute of Metrology, Beijing 100029, China
2. Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China
全文: PDF (98401 KB)   HTML (1 KB) 
输出: BibTeX | EndNote (RIS)      
摘要 由于世界卫生组织(WHO)将B.1.1.7(Alpha)列为“关切的变异株”,因此对其建立特异性的高灵敏数字PCR方法尤为重要。该方法需首先根据该变异株刺突蛋白的H69/V70缺失、P681H和A570D 3个特异突变位点设计引物探针,确定3个方法的线性范围和定量限;随后再用其他4个“关切的变异株”验证该方法的特异性,并用不同数字PCR平台和不同方法进行定量准确性的比较;最终,结果表明建立的数字PCR方法准确可靠,可用于B.1.1.7变异株的定量检测。
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作者相关文章
王霞
郭若晖
董莲华
关键词 计量学新型冠状病毒;B.1.1.7变异株;定量检测;数字PCR    
Abstract:Due to B.1.1.7 (Alpha) being listed as a “variant of concern” by the World Health Organization (WHO), it is particularly important to establish a specific and highly sensitive digital PCR method for it. First, this method required designing primer probes based on the H69/V70 deletion, P681H, and A570D specific mutation sites of the mutant spike protein, and determining the linear range and limit of quantitation for the three methods. Subsequently, the specificity of the method was verified using four other “variant of concern”, and quantitative accuracy was compared using different digital PCR platforms and methods. Finally, the results indicated that the established digital PCR method was accurate and reliable, and can be used for quantitative detection of B.1.1.7 variant strains.
Key wordsmetrology    SARS-CoV-2    B.1.1.7 variant    quantitative detection    digital PCR
收稿日期: 2022-12-13      发布日期: 2023-05-18
PACS:  TB99  
基金资助:中国计量科学研究院基本科研业务费(AKYZZ2126)
通讯作者: 董莲华(1981-),女,河北涞水人,中国计量科学研究院研究员,主要从事生物计量方面的研究。Email: donglh@nim.ac.cn     E-mail: lianhuadong@126.com
作者简介: 王霞(1994-),女,河北保定人,中国计量科学研究院助理工程师,硕士,主要从事核酸计量工作研究。Email: wangxia@nim.ac.cn
引用本文:   
王霞,郭若晖,董莲华. 新型冠状病毒B.1.1.7变异株特异性数字PCR定量方法研究[J]. 计量学报, 2023, 44(5): 826-832.
WANG Xia,GUO Ruo-hui,DONG Lian-hua. The Establishment of Digital PCR Quantitative Method for Strain B.1.1.7 of SARS-CoV-2. Acta Metrologica Sinica, 2023, 44(5): 826-832.
链接本文:  
http://jlxb.china-csm.org:81/Jwk_jlxb/CN/10.3969/j.issn.1000-1158.2023.05.23     或     http://jlxb.china-csm.org:81/Jwk_jlxb/CN/Y2023/V44/I5/826
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